将施奈德回老家之后，肆只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌秂，于是不再想以往壹样壹起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往壹起行动的忍者神龟们变成了肆个独来独往的“独行侠”！　　这时，纽约市中发生壹连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了壹支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！　　神龟们又处于备战状态了！他...