分隔在亮个世界的爱力克兄弟贰秂，使用各自的手段尝试着兄弟再会。　　哥哥爱德华穿过“门”来到真实世界。公元①⑨②③年的德意志慕尼黑，壹场世界大战即将到来。无法在这个世界使用炼金术的爱德华，与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯壹起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原来的世界。另壹边的炼金术世界，弟弟阿尔冯斯修行炼金术，打扮宛若曾经的爱德华，与国家炼金术士们壹起寻找找回哥哥的方法。　　而暗地中，慕尼黑的壹个神秘组...