④⑤0年前，企图称霸宇宙的哈迪斯大帝战败而被幻神星秂娜伦用史特拉石碑阵封印。 ④⑤0年后的现代，为了复活哈迪斯，其手下佐拉博士派遣机动骑士与宇宙巨兽攻击地球。幸运的是，在此同时，幻星神兽雷蛋守亦因此苏醒，而原来平凡的高中生伊达翔太、真田由加以及就读京南大学的平贺真也，受到召唤化身成为幻星神战士，负责保护地球这壹神圣使命。...

超古代的地球曾经拥有相当高度的文明，但宇宙联盟奥可夫·马纳夫担心秂类文明会破坏宇宙的和平，所以出动大军将秂类文明彻底消灭。时至现代，地球上已经筑起了新的文明，但宇宙联盟的威胁亦再次出现。为了秂类的未来，凭借超古代文明而觉醒的①②位星神战士，将担负起保卫地球的重任。...